در دنیای آینده که توسط بیماری ویران شده است، یک محکوم در زمان به عقب فرستاده می شود تا اطلاعاتی در مورد ویروس ساخته دست بشر که بیشتر جمعیت انسانی را در این سیاره از بین برده است، جمع آوری کند.
یک موجود سیاهپوست عجیب از دنیایی دیگر با پیتر پارکر پیوند میخورد و باعث آشفتگی درونی میشود، زیرا او با شروران جدید، وسوسهها و انتقامگیری مبارزه میکند.
یک پارک موضوعی جدید که در محل اصلی پارک ژوراسیک ساخته شده است، یک دایناسور هیبریدی اصلاح شده ژنتیکی به نام Indominus Rex را ایجاد می کند که از کنترل فرار می کند و به کشتار می رود.
در دهه 1960، انسان های فوق العاده چارلز خاویر و اریک لنشر با هم کار می کنند تا افراد دیگری مانند آنها را بیابند، اما تعقیب انتقام جویانه اریک از یک جهش یافته جاه طلب که زندگی او را ویران کرد باعث ایجاد شکافی بین آنها می شود.
پس از اینکه پیتر پارکر توسط یک عنکبوت تغییر یافته ژنتیکی نیش میزند، او قدرتهای جدید و عنکبوتمانندی را به دست میآورد و برای نجات شهر از دسیسههای یک دشمن خزنده مرموز تلاش میکند.
پیتر پارکر تلاش میکند تا آدریان «کرکس» تومز را از فروش سلاحهای ساخته شده با فناوری پیشرفته چیتاوری منع کند، در حالی که سعی میکند زندگی خود را به عنوان یک دانشآموز متوسطه معمولی متعادل کند.
مردان ایکس ولورین را در تلاشی مذبوحانه به گذشته می فرستند تا تاریخ را تغییر دهند و از رویدادی جلوگیری کنند که منجر به عذاب هم برای انسان ها و هم برای جهش یافته ها می شود.